La melatonina es una de las sustancias menos tóxicas conocidas. La gente ha tomado tanto como 6 gramos (600 a 3000 veces la dosificación normal) de la sustancia en estudios cuidadosamente vigilados sin la menor muestra de toxicidad. Solamente cuatro quejas con respecto a melatonina han sido formuladas frente al FDA ( Administración Federal de Drogas y Alimentos de US ).

El único efecto secundario constante en las altas dosis ha sido somnolencia y un tiempo de reacción más lento. En el ensayo clínico más extenso hasta la fecha una alta dosis de 75 miligramos de melatonina por día fue dada a 1400 mujeres en los Países Bajos por hasta cuatro años sin efectos ...